Xã Mỹ Thuận nằm ở phía nam huyện Mỹ Tú, có vị trí địa lý:

• Phía đông giáp các xã Thuận Hưng và Phú Mỹ
• Phía tây giáp xã Mỹ Phước và huyện Thạnh Trị
• Phía nam giáp các huyện Thạnh Trị và Mỹ Xuyên
• Phía bắc giáp các xã Mỹ Tú và Thuận Hưng.

Xã có diện tích 31,03 km², dân số năm 1999 là 8.878 người[3], mật độ dân số đạt 286 người/km².